Projektitutkijaksi koneoppimisen ja lääketieteellisen kuvantamisen alalle / Project Researcher in Machine Learning and Medical Imaging

IN ENGLISH BELOW

Tule tutkijaksi Pohjois-Savoon!

Kuopion yliopistollisessa sairaalassa Pohjois-Savon hyvinvointialueella on avoinna vuoden mittainen projektitutkijan tehtävä, joka on mahdollista laajentaa väitöskirjahankkeeksi. Hanke keskittyy koneoppimiseen, kuva-analyysiin ja rekisteritutkimukseen osteoporoosin ja murtumariskin tutkimuksessa. Tehtävä sijaitsee Kuopiossa. Tutkimus tehdään pääosin Kuopion yliopistollisessa sairaalassa, mutta tutkija voi työskennellä osan viikosta Itä-Suomen yliopistossa, ja mahdollinen väitöskirja tehdään Itä-Suomen yliopistoon (UEF).

Tutkimusprojektin kuvaus

Tutkija työskentelee Suomen Akatemian ja Pohjois-Savon hyvinvointialueen rahoittamassa tutkimushankkeessa. Hankkeessa kehitetään uusia teknologisia, laskennallisia sekä kone ja syväoppimiseen perustuvia analyysimenetelmiä osteoporoosin diagnostiikkaa ja murtumien ennustamista varten. Hankkeessa tutkija kehittää syvällisen osaamisen koneoppimisessa, kuvantamisen analyysissä, potilasrekisteriaineistojen analyysissä sekä potilasmittaustekniikoissa. Projektilla on käytössään laaja potilasaineisto, joka kattaa useita kuvantamistekniikoita (TT, MRI, DXA ja röntgen). Lisäksi käytössä on myös potilasrekisteritiedot, mukaan lukien potilasdiagnoosit, radiologiset lausunnot, sairaalakäyntitiedot sekä muut potilasasiakirjat. Tutkimushankkeen tavoitteena on viedä kehitetyt data- ja kuva-analyysimenetelmät kliiniseen käyttöön tukemaan kliinikkoja heidän päivittäisessä työssään osteoporoosin diagnostiikassa ja murtumariskin arvioinnissa. Tutkimusprojekti on luonteeltaan monitieteinen ja yhdistää lääketieteellisen fysiikan, teknologian, terveysinformatiikan sekä kliinisen radiologian ja fysiologian osa-alueita. Tämä tutkimushanke on erinomainen tilaisuus akateemisesta urasta kiinnostuneelle sekä sairaalafyysikon uraa tavoittelevalle. Väitöskirjatyön ohella tehtävään valittu tutkija voi ohjata kandidaatti ja maisteri-/diplomi-insinööriopiskelijoita sekä osallistua opetustyöhön.

Tutkimusryhmässä aiemmin tehdyn tutkimuksen pohjalta tämän projektin ensimmäinen tehtävä keskittyy murtumien automaattiseen havaitsemiseen röntgenkuvista. Projektin mahdolliset tulevat tehtävät voidaan muodostaa tehtävään valitun tutkijan aiemman osaamisen ja mielenkiinnon perusteella. Osa-alueita ovat:

• Potilaskuvien ja muiden potilasaineistojen analysointi tekoälyn ja koneoppimisen menetelmillä

• Suurten potilaskuva- ja data-aineistojen käsittely

• Koneoppimismenetelmien vieminen osaksi lääkärien kliinistä työtä

• Uusien lääketieteellisten potilasmittausmenetelmien ja laitteiden kehittäminen

• Potilasmittausten parissa työskentely

📋Tehtävät

• Koneoppimismenetelmien kehittäminen ja tutkiminen

• Suurten potilasaineistojen analysointi: useita satoja tuhansia potilaita, miljoonia kuvia ja 100 miljoonaa rekisterimerkintää

• Osallistuminen potilasmittauksiin ja tulosten raportointiin

• Tieteellisten artikkeleiden kirjoittaminen

• Mikäli kiinnostunut väitöskirjaprojektista, ulkopuolisen rahoituksen ja apurahojen hakeminen väitöskirjaprojektin rahoituksen turvaamiseksi

• Mahdollisuus opetus- ja ohjaustehtäviin

• Kansainvälinen tieteellinen yhteistyö sekä mahdollisuus muutaman kuukauden mittaiseen vierailuun ulkomaiseen tutkimuslaboratorioon

✅Vaatimukset ja eduksi luettavat tiedot/taidot

• Soveltuva ylempi tiedekorkeakoulututkinto tai valmistuminen lähitulevaisuudessa: FM, DI tietojenkäsittelytieteessä, lääketieteellisessä fysiikassa, lääketieteellisessä tekniikassa, biolääketieteen tekniikassa tai muulla soveltuvalla alalla

• Kokemusta neuroverkkojen kanssa työskentelystä

• Ohjelmointitaidot (Python, Matlab) sekä relaatiotietokantojen ja SQL:n tuntemus luetaan eduksi

• Kokemus lääketieteellisten kuvantamisaineistojen analysoinnista luetaan eduksi

• Sujuva kirjallinen ja suullinen englannin kielen taito

• Kyky työskennellä monialaisessa kansainvälisessä tiimissä sekä hyvät yhteistyötaidot

Työympäristö

Tutkija työskentee Kuopion yliopistollisessa sairaalan Kuvantamiskeskuksessa sekä Teknillisen Fysiikan laitoksella Itä-Suomen yliopistossa. Sairaalan ja yliopiston tutkimusinfra on projektin käytössä. Jos hankkeen haluaa laajentaa väitöskirjaprojektiksi, valittavan tutkijan tulee olla kelpoinen jatko-opintoihin Itä-Suomen yliopistossa ja hakeutua tiedekunnan LUMETO-tohtoriohjelmaan. Tutkija työskentelee tiiviissä yhteistyössä Biofysiikan ja Kuopio Musculoskeletal Research Unit (KMRU) -tutkimusryhmien kanssa osana Tuki- ja liikuntaelimistön terveys ja teknologia -tutkimusyhteisöä. Työnantajana toimii Pohjois-Savon hyvinvointialue kilpailullisen tutkimusrahoituksen kautta. Tutkimus on osa laajempaa kansainvälistä tutkimusyhteistyötä. Tutkimusyhteistyöhön kuuluvissa ryhmissä tehdään maailmanlaajuisesti arvostettua osteoporoosin ja murtumariskin diagnostiikan parantamiseen liittyvää tutkimusta.

Paikka täytetään heti, kun oikea ehdokas löytyy. Otamme vastaan hakemuksia (sis. CV:n, 1-2 sivun motivaatiokirjeen, mahdollisen julkaisuluettelon ja opintorekisterit) tämän työpaikkailmoituksen kautta.

Tutkijan palkka projektin alussa on 2 800 €/kk. Tehtävän kesto on ajalle 1.8.2026 (tai sopimuksen mukaan) – 30.8.2027 tehtävän projektiluontoisuuden vuoksi. Lisärahoitusta haetaan aktiivisesti projektin jatkamiseksi, ja tutkijaa tuetaan apuraha- ja rahoitushakemusten laatimisessa tulevan rahoituksen varmistamiseksi. Tehtävän mahdollisesta jatkosta sovitaan erikseen. Projektissa noudatetaan koeaikaa (maksimissaan kuusi (6) kuukautta)

Tule mukaan tekemään hyvää Pohjois-Savon hyvinvointialueelle!

IN ENGLISH

Become a researcher in North Savo!

A one year project researcher position that can be broadened to a PhD project is available at Kuopio University Hospital in the Wellbeing Services County of North Savo. The project covers machine learning, image analysis, and patient register analysis in osteoporosis and fracture risk research. The position is in Kuopio, Finland. The research is conducted mainly at the Kuopio University Hospital, but the researcher can work part of the week at the University of Eastern Finland (UEF) and the PhD dissertation is made for UEF.

📋Description of the p

Pohjois-Savon hyvinvointialue vastaa alueensa sosiaali-, terveys- ja pelastustoimen palveluista. Kuopion yliopistollinen sairaala tarjoaa erikoissairaanhoitoa ja vastaa noin miljoonan ihmisen vaativasta hoidosta itäisessä suomessa. Meillä yli 12 000 ammattilaista tekee työtä vastuullisesti yhteisen tavoitteen eteen – Pohjois-Savon ja sen ihmisten hyväksi.

Teemme työtä yhdessä, yhtenä joukkueena arvojemme mukaan Ihminen - Tärkein Vastuullisesti - Totta kai Yhteistyöllä - Aina

Hyveemme – arkijärkisyys, avuliaisuus, huumorintajuisuus, joukkuehenkisyys, joustavuus, keskustelevuus, luotettavuus, oikeudenmukaisuus, vastuullisuus ja ystävällisyys – ohjaavat meitä rakentamaan Pohjois-Savoon parasta mahdollista hyvinvointia, joka näkyy arjen teoissa.